Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg16l2Q6KAU8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg16l2Q6KAU8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms