Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cep78Q6IRU7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cep78Q6IRU7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms