Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Usp7Q6A4J8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp7Q6A4J8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp7Q6A4J8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp7Q6A4J8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Usp7Q6A4J8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Usp7Q6A4J8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Usp7Q6A4J8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Usp7Q6A4J8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp7Q6A4J8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms