Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rftn1Q6A0D4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms