Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmcc1Q69ZZ6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms