Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msl2Q69ZF8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms