Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Surf4Q64310 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Surf4Q64310 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms