Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup62Q63850 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nup62Q63850 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup62Q63850 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup62Q63850 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup62Q63850 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup62Q63850 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup62Q63850 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms