Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp4Q62445 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp4Q62445 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms