Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nptx1Q62443 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nptx1Q62443 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms