Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Taf6Q62311 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Taf6Q62311 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms