Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spock1Q62288 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spock1Q62288 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms