Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18Q62280 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ss18Q62280 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ss18Q62280 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms