Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SypQ62277 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SypQ62277 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SypQ62277 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SypQ62277 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SypQ62277 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SypQ62277 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SypQ62277 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms