Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Phox2aQ62066 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Phox2aQ62066 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms