Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrn1Q61809 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrn1Q61809 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms