Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd55bQ61476 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd55bQ61476 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms