Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msi1Q61474 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms