Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcanQ61361 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BcanQ61361 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BcanQ61361 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BcanQ61361 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BcanQ61361 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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