Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tfap2bQ61313 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tfap2bQ61313 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms