Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbbp7Q60973 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbbp7Q60973 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms