Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kpna1Q60960 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kpna1Q60960 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms