Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Epha1Q60750 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Epha1Q60750 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms