Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms