Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med13Q5SWW4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms