Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn1r196Q5SVD5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms