Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc42Q5SV66 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms