Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms