Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AbrQ5SSL4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
AbrQ5SSL4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms