Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm27Q5SFM8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm27Q5SFM8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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