Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trav6-2Q5R1I4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trav6-2Q5R1I4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms