Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kdm6bQ5NCY0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kdm6bQ5NCY0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms