Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc1Q5NCF2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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