Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q5EBG8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q5EBG8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q5EBG8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q5EBG8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms