Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp22Q5DU02 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp22Q5DU02 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms