Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU00

Dcdc2, Doublecortin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2Q5DU00 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dcdc2Q5DU00 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dcdc2Q5DU00 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms