Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opa3Q505D7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opa3Q505D7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms