Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc84Q4VA36 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms