Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc2Q4U2R1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc2Q4U2R1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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