Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms