Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc27Q3V036 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms