Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm27235Q3UW50 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm27235Q3UW50 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm27235Q3UW50 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm27235Q3UW50 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm27235Q3UW50 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm27235Q3UW50 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm27235Q3UW50 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm27235Q3UW50 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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