Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clpsl2Q3UW21 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms