Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chpf2Q3UU43 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms