Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms