Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc61Q3UJV1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms