Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Plxnd1Q3UH93 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plxnd1Q3UH93 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plxnd1Q3UH93 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plxnd1Q3UH93 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plxnd1Q3UH93 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plxnd1Q3UH93 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plxnd1Q3UH93 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plxnd1Q3UH93 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plxnd1Q3UH93 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Plxnd1Q3UH93 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plxnd1Q3UH93 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Plxnd1Q3UH93 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms