Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc58Q3UGP9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc58Q3UGP9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms