Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph3aQ3UFY4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms