Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pid1Q3UBG2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms